Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
La succinato deshidrogenasa [ubiquinona] citocromo b subunidad pequeña mitocondrial (CybS), también conocida como subunidad D del complejo succinato deshidrogenasa (SDHD), es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen SDHD . Los nombres utilizados anteriormente para SDHD eran PGL y PGL1 . La succinato deshidrogenasa es una enzima importante tanto en el ciclo del ácido cítrico como en la cadena de transporte de electrones . [5] [6] [7] El síndrome PGL-PCC hereditario es causado por una impronta parental del gen SDHD. La detección puede comenzar a los 6 años de edad.
Estructura
El gen SDHD se encuentra en el cromosoma 11 en el locus 11q23 y abarca 8.978 pares de bases . Existen pseudogenes para este gen en los cromosomas 1 , 2 , 3 , 7 y 18. [5] El gen SDHD produce una proteína de 17 kDa compuesta por 159 aminoácidos . [8] [9]
La proteína SDHD es una de las dos subunidades transmembrana integrales que anclan el complejo proteico de cuatro subunidades de la succinato deshidrogenasa (Complejo II) al lado de la matriz de la membrana interna mitocondrial . La otra subunidad transmembrana es la SDHC . El dímero SDHC /SDHD está conectado a la subunidad de transporte de electrones SDHB que, a su vez, está conectada a la subunidad SDHA . [10]
Función
La SDHD forma parte del dímero proteico transmembrana con SDHC que ancla el Complejo II a la membrana mitocondrial interna. El dímero SDHC/SDHD proporciona sitios de unión para la ubiquinona y el agua durante el transporte de electrones en el Complejo II. Inicialmente, la SDHA oxida el succinato a través de la desprotonación en el sitio de unión de FAD , dejando al fumarato , unido débilmente al sitio activo, libre para salir de la proteína. Los electrones derivados del succinato hacen un túnel a lo largo del relevo [Fe-S] en la subunidad SDHB hasta que alcanzan el grupo hierro-azufre [3Fe-4S] . Luego, los electrones se transfieren a una molécula de ubiquinona que espera en el sitio activo en el dímero SDHC/SDHD. El oxígeno del carbonilo O1 de la ubiquinona está orientado en el sitio activo (imagen 4) por interacciones de enlace de hidrógeno con Tyr83 de SDHD. La presencia de electrones en el grupo hierro-azufre [3Fe-4S] induce el movimiento de la ubiquinona hacia una segunda orientación. Esto facilita una segunda interacción de enlace de hidrógeno entre el grupo carbonilo O4 de la ubiquinona y Ser27 de la subunidad C. Después del primer paso de reducción de un solo electrón, se forma una especie de radical semiquinona . El segundo electrón llega desde el grupo [3Fe-4S] para proporcionar la reducción completa de la ubiquinona a ubiquinol . [11]
Importancia clínica
Las mutaciones en el gen SDHD pueden causar paragangliomas familiares . [5] Las mutaciones de la línea germinal en SDHD se relacionaron por primera vez con paragangliomas hereditarios en 2000. [12] Desde entonces, se ha demostrado que las mutaciones en SDHB y, en menor grado, en SDHC pueden causar parangliomas, así como feocromocitomas familiares . Cabe destacar que el espectro tumoral es diferente para las diferentes mutaciones. Las mutaciones de SDHB a menudo conducen a una enfermedad metastásica que es extrasuprarrenal, mientras que los tumores relacionados con la mutación de SDHD son más típicamente benignos y se originan en la cabeza y el cuello. [13]
El mecanismo exacto de la tumorigénesis no está determinado, pero se sospecha que el mal funcionamiento del complejo SDH puede causar una respuesta hipóxica en la célula que conduce a la formación de tumores. Las mutaciones en los genes SDHB , SDHC , SDHD y SDHAF2 conducen a la pérdida o reducción de la actividad de la enzima SDH. Debido a que la enzima SDH mutada no puede convertir succinato en fumarato, el succinato se acumula en la célula. Como resultado, las vías de hipoxia se activan en condiciones normales de oxígeno, lo que conduce al crecimiento celular anormal y la formación de tumores. [13] Se sabe que las personas que viven a mayores altitudes (por ejemplo, las montañas de los Andes) tienen una mayor tasa de paragangliomas benignos, y la tasa de la enfermedad aumenta con la altitud de la población.
Se han identificado al menos cinco variantes del gen SDHD en personas con síndrome de Cowden o un trastorno similar llamado síndrome similar a Cowden. Estas afecciones se caracterizan por múltiples crecimientos similares a tumores llamados hamartomas y un mayor riesgo de desarrollar ciertos tipos de cáncer. Cuando el síndrome de Cowden y el síndrome similar a Cowden son causados por mutaciones del gen SDHD, las afecciones se asocian con un riesgo particularmente alto de desarrollar cáncer de mama y tiroides . Las variantes del gen SDHD asociadas con el síndrome de Cowden y el síndrome similar a Cowden cambian aminoácidos individuales en la proteína SDHD, lo que probablemente altera la función de la enzima SDH. Los estudios sugieren que la enzima defectuosa podría permitir que las células crezcan y se dividan sin control, lo que lleva a la formación de hamartomas y tumores cancerosos. Sin embargo, los investigadores no están seguros de si las variantes del gen SDHD identificadas están directamente asociadas con el síndrome de Cowden y el síndrome similar a Cowden. Algunas de las variantes descritas anteriormente rara vez se han encontrado en personas sin las características de estas afecciones. [14]
Se han encontrado mutaciones en el gen SDHD en un pequeño número de personas con síndrome de Carney-Stratakis , una forma hereditaria de un cáncer del tracto gastrointestinal llamado tumor del estroma gastrointestinal (GIST). Las personas con síndrome de Carney-Stratakis presentan un tumor no canceroso asociado con el sistema nervioso llamado paraganglioma o feocromocitoma (un tipo de paraganglioma). Una mutación hereditaria del gen SDHD predispone a un individuo a la formación de cáncer. Se necesita una mutación adicional que elimine la copia normal del gen para causar el síndrome de Carney-Stratakis. Esta segunda mutación, llamada mutación somática , se adquiere durante la vida de una persona y está presente solo en las células tumorales. [14]
La deficiencia del complejo mitocondrial II (MT-C2D), un trastorno de la cadena respiratoria mitocondrial con manifestaciones clínicas heterogéneas, también se ha asociado con mutaciones en el gen SDHD . Las características clínicas incluyen regresión psicomotora en bebés, crecimiento deficiente con falta de desarrollo del habla, cuadriplejia espástica grave, distonía, leucoencefalopatía progresiva, debilidad muscular, intolerancia al ejercicio y miocardiopatía. Algunos pacientes manifiestan síndrome de Leigh o síndrome de Kearns-Sayre . [15] [16] [17]
Mapa interactivo de rutas
Haga clic en los genes, proteínas y metabolitos que aparecen a continuación para acceder a los artículos correspondientes. [§ 1]
- ^ El mapa interactivo de la ruta se puede editar en WikiPathways: "TCACycle_WP78".
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000204370 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000000171 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ abc "Gen Entrez: complejo succinato deshidrogenasa".
- ^ Heutink P, van der Mey AG, Sandkuijl LA, van Gils AP, Bardoel A, Breedveld GJ, van Vliet M, van Ommen GJ, Cornelisse CJ, Oostra BA (abril de 1992). "Un gen sujeto a impronta genómica y responsable de los mapas de paragangliomas hereditarios en el cromosoma 11q23-qter". Genética Molecular Humana . 1 (1): 7–10. doi :10.1093/hmg/1.1.7. PMID 1301144.
- ^ Hirawake H, Taniwaki M, Tamura A, Kojima S, Kita K (1997). "Citocromo b en el complejo humano II (succinato-ubiquinona oxidorreductasa): clonación de ADNc de los componentes en las mitocondrias del hígado y asignación cromosómica de los genes para las subunidades grande (SDHC) y pequeña (SDHD) a 1q21 y 11q23". Citogenética y genética celular . 79 (1–2): 132–8. doi :10.1159/000134700. PMID 9533030.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (octubre de 2013). "Integración de la biología y la medicina del proteoma cardíaco mediante una base de conocimiento especializada". Circulation Research . 113 (9): 1043–53. doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475 . PMID 23965338.
- ^ "SDHD - Subunidad pequeña del citocromo b de la succinato deshidrogenasa [ubiquinona], mitocondrial". Base de conocimiento del Atlas de proteínas de organelas cardíacas (COPaKB) .
- ^ Sun F, Huo X, Zhai Y, Wang A, Xu J, Su D, Bartlam M, Rao Z (julio de 2005). "Estructura cristalina del complejo II de proteínas de la membrana respiratoria mitocondrial". Cell . 121 (7): 1043–57. doi : 10.1016/j.cell.2005.05.025 . PMID 15989954. S2CID 16697879.
- ^ Horsefield R, Yankovskaya V, Sexton G, Whittingham W, Shiomi K, Omura S, Byrne B, Cecchini G, Iwata S (marzo de 2006). "Análisis estructural y computacional del sitio de unión de quinona del complejo II (succinato-ubiquinona oxidorreductasa): un mecanismo de transferencia de electrones y conducción de protones durante la reducción de ubiquinona". The Journal of Biological Chemistry . 281 (11): 7309–16. doi : 10.1074/jbc.m508173200 . PMID 16407191.
- ^ Baysal BE, Ferrell RE, Willett-Brozick JE, Lawrence EC, Myssiorek D, Bosch A, van der Mey A, Taschner PE, Rubinstein WS, Myers EN, Richard CW, Cornelisse CJ, Devilee P, Devlin B (febrero de 2000) . "Mutaciones en SDHD, un gen del complejo II mitocondrial, en paraganglioma hereditario". Ciencia . 287 (5454): 848–51. Código bibliográfico : 2000Sci...287..848B. doi : 10.1126/ciencia.287.5454.848. PMID 10657297.
- ^ ab "Paraganglioma-feocromocitoma hereditario". Genetics Home Reference . Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . . Consultado el 26 de marzo de 2015 .
- ^ ab "SDHD". Genetics Home Reference . Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . . Consultado el 26 de marzo de 2015 .
- ^ "Gen SDHD". www.genecards.org . Base de datos de genes humanos GeneCards . Consultado el 30 de julio de 2018 .
- ^ Jackson CB, Nuoffer JM, Hahn D, Prokisch H, Haberberger B, Gautschi M, Häberli A, Gallati S, Schaller A (marzo de 2014). "Las mutaciones en SDHD conducen a encefalomiopatía autosómica recesiva y deficiencia aislada del complejo mitocondrial II". Journal of Medical Genetics . 51 (3): 170–5. doi :10.1136/jmedgenet-2013-101932. PMID 24367056. S2CID 25057245.
- ^ Alston CL, Ceccatelli Berti C, Blakely EL, Oláhová M, He L, McMahon CJ, Olpin SE, Hargreaves IP, Nolli C, McFarland R, Goffrini P, O'Sullivan MJ, Taylor RW (agosto de 2015). "Una mutación homocigótica recesiva p.Asp92Gly SDHD causa miocardiopatía prenatal y una deficiencia grave del complejo mitocondrial II". Genética humana . 134 (8): 869–79. doi :10.1007/s00439-015-1568-z. PMC 4495259 . PMID 26008905.
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público .
Lectura adicional
- Bayley JP, Weiss MM, Grimbergen A, van Brussel BT, Hes FJ, Jansen JC, Verhoef S, Devilee P, Corssmit EP, Vriends AH (septiembre de 2009). "Caracterización molecular de nuevas deleciones de la línea germinal que afectan a SDHD y SDHC en pacientes con feocromocitoma y paraganglioma". Cáncer relacionado con el sistema endocrino . 16 (3): 929–37. doi : 10.1677/ERC-09-0084 . PMID 19546167.
- Gaal J, Burnichon N, Korpershoek E, Roncelin I, Bertherat J, Plouin PF, de Krijger RR, Gimenez-Roqueplo AP, Dinjens WN (marzo de 2010). "Las mutaciones de la isocitrato deshidrogenasa son raras en feocromocitomas y paragangliomas". The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 95 (3): 1274–8. doi : 10.1210/jc.2009-2170 . PMID 19915015.
- Milosevic D, Lundquist P, Cradic K, Vidal-Folch N, Huynh T, Pacak K, Grebe SK (mayo de 2010). "Desarrollo y validación de un ensayo integral de detección de mutaciones y deleciones para SDHB, SDHC y SDHD". Bioquímica clínica . 43 (7–8): 700–4. doi :10.1016/j.clinbiochem.2010.01.016. PMC 3419008 . PMID 20153743.
- Janecke AR, Willett-Brozick JE, Karas C, Hasipek M, Loeffler-Ragg J, Baysal BE (marzo de 2010). "Identificación de una deleción de SDHD fundadora mediada por Alu de 4,9 kilo pares de bases en dos familias extensas de paragangliomas de Austria". Journal of Human Genetics . 55 (3): 182–5. doi : 10.1038/jhg.2009.142 . PMID 20111059.
- Cascón A, López-Jiménez E, Landa I, Leskelä S, Leandro-García LJ, Maliszewska A, Letón R, de la Vega L, García-Barcina MJ, Sanabria C, Alvarez-Escolá C, Rodríguez-Antona C, Robledo M (Septiembre de 2009). "Racionalización de las pruebas genéticas en pacientes con feocromocitoma/paraganglioma aparentemente esporádico". Investigación hormonal y metabólica . 41 (9): 672–5. doi :10.1055/s-0029-1202814. PMID 19343621. S2CID 24979281.
- Waldmann J, Langer P, Habbe N, Fendrich V, Ramaswamy A, Rothmund M, Bartsch DK, Slater EP (junio de 2009). "Mutaciones y polimorfismos en los genes SDHB, SDHD, VHL y RET en feocromocitomas esporádicos y familiares". Endocrino . 35 (3): 347–55. doi :10.1007/s12020-009-9178-y. PMID 19399650. S2CID 8986765.
- Ricketts CJ, Forman JR, Rattenberry E, Bradshaw N, Lalloo F, Izatt L, Cole TR, Armstrong R, Kumar VK, Morrison PJ, Atkinson AB, Douglas F, Ball SG, Cook J, Srirangalingam U, Killick P, Kirby G, Aylwin S, Woodward ER, Evans DG, Hodgson SV, Murday V, Chew SL, Connell JM, Blundell TL, Macdonald F, Maher ER (enero de 2010). "Riesgos tumorales y análisis de genotipo-fenotipo-proteotipo en 358 pacientes con mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHD". Human Mutation . 31 (1): 41–51. doi : 10.1002/humu.21136 . PMID 19802898. S2CID 22888808.
- Gill AJ, Benn DE, Chou A, Clarkson A, Muljono A, Meyer-Rochow GY, Richardson AL, Sidhu SB, Robinson BG, Clifton-Bligh RJ (junio de 2010). "Inmunohistoquímica para la clasificación de SDHB: pruebas genéticas de SDHB, SDHC y SDHD en síndromes de paraganglioma-feocromocitoma". Patología humana . 41 (6): 805–14. doi :10.1016/j.humpath.2009.12.005. PMID 20236688.
- Martin TP, Irving RM, Maher ER (febrero de 2007). "La genética de los paragangliomas: una revisión". Otorrinolaringología clínica . 32 (1): 7–11. doi : 10.1111/j.1365-2273.2007.01378.x . PMID 17298303.
- Eng C, Kiuru M, Fernandez MJ, Aaltonen LA (marzo de 2003). "Un papel para las enzimas mitocondriales en la neoplasia hereditaria y más allá". Nature Reviews. Cancer . 3 (3): 193–202. doi :10.1038/nrc1013. PMID 12612654. S2CID 20549458.
- Talmud PJ, Drenos F, Shah S, Shah T, Palmen J, Verzilli C, Gaunt TR, Pallas J, Lovering R, Li K, Casas JP, Sofat R, Kumari M, Rodriguez S, Johnson T, Newhouse SJ, Dominiczak A, Samani NJ, Caulfield M, Sever P, Stanton A, Shields DC, Padmanabhan S, Melander O, Hastie C, Delles C, Ebrahim S, Marmot MG, Smith GD, Lawlor DA, Munroe PB, Day IN, Kivimaki M, Whittaker J, Humphries SE, Hingorani AD (noviembre de 2009). "Señales de asociación centradas en genes para lípidos y apolipoproteínas identificadas a través del HumanCVD BeadChip". American Journal of Human Genetics . 85 (5): 628–42. doi :10.1016/j.ajhg.2009.10.014. PMC 2775832. PMID 19913121 .
- Hermsen MA, Sevilla MA, Llorente JL, Weiss MM, Grimbergen A, Allonca E, Garcia-Inclán C, Balbín M, Suárez C (enero de 2010). "Relevancia del cribado de mutaciones de la línea germinal en paragangliomas de cabeza y cuello familiares y esporádicos para el diagnóstico temprano y el tratamiento clínico". Oncología celular . 32 (4): 275–83. doi :10.3233/CLO-2009-0498. PMC 4619289 . PMID 20208144.
- Hensen EF, Jansen JC, Siemers MD, Oosterwijk JC, Vriends AH, Corssmit EP, Bayley JP, van der Mey AG, Cornelisse CJ, Devilee P (enero de 2010). "La mutación fundadora holandesa SDHD.D92Y muestra una penetración reducida para el desarrollo de paragangliomas en una gran familia multigeneracional". Revista Europea de Genética Humana . 18 (1): 62–6. doi :10.1038/ejhg.2009.112. PMC 2987152 . PMID 19584903.
- Brière JJ, Favier J, El Ghouzzi V, Djouadi F, Bénit P, Gimenez AP, Rustin P (octubre de 2005). "Deficiencia de succinato deshidrogenasa en humanos". Ciencias de la vida celulares y moleculares . 62 (19–20): 2317–24. doi :10.1007/s00018-005-5237-6. PMC 11139140 . PMID 16143825. S2CID 23793565.
- Richalet JP, Gimenez-Roqueplo AP, Peyrard S, Vénisse A, Marelle L, Burnichon N, Bouzamondo A, Jeunemaitre X, Azizi M, Elghozi JL (diciembre de 2009). "¿Un papel para los genes de la succinato deshidrogenasa en la baja quimiorrespuesta a la hipoxia?". Clinical Autonomic Research . 19 (6): 335–42. doi :10.1007/s10286-009-0028-z. PMID 19768395. S2CID 2265162.
- Sevilla MA, Hermsen MA, Weiss MM, Grimbergen A, Balbín M, Llorente JL, Rodrigo JP, Suárez C (mayo de 2009). "Cambios cromosómicos en paragangliomas de cabeza y cuello esporádicos y familiares". Otorrinolaringología–Cirugía de cabeza y cuello . 140 (5): 724–9. doi :10.1016/j.otohns.2009.01.004. PMID 19393419. S2CID 5393912.
- Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA, Goedert JJ, Kirk GD, Gomperts ED, Buchbinder SP, Troyer JL, O'Brien SJ (septiembre de 2010). "Las variantes genéticas en genes mitocondriales codificados nucleares influyen en la progresión del SIDA". MÁS UNO . 5 (9): e12862. Código Bib : 2010PLoSO...512862H. doi : 10.1371/journal.pone.0012862 . PMC 2943476 . PMID 20877624.
- Erlic Z, Rybicki L, Peczkowska M, Golcher H, Kann PH, Brauckhoff M, Müssig K, Muresan M, Schäffler A, Reisch N, Schott M, Fassnacht M, Opocher G, Klose S, Fottner C, Forrer F, Plöckinger U , Petersenn S, Zabolotny D, Kollukch O, Yaremchuk S, Januszewicz A, Walz MK, Eng C, Neumann HP (octubre de 2009). "Predictores clínicos y algoritmo para el diagnóstico genético de pacientes con feocromocitoma". Investigación clínica del cáncer . 15 (20): 6378–85. doi :10.1158/1078-0432.CCR-09-1237. Número de modelo: PMID 19825962. Número de modelo: S2CID 6225809.
- Krawczyk A, Hasse-Lazar K, Pawlaczek A, Szpak-Ulczok S, Krajewska J, Paliczka-Cieślak E, Jurecka-Lubieniecka B, Roskosz J, Chmielik E, Ziaja J, Cierpka L, Peczkowska M, Preibisz A, Januszewicz A, Otto M, Jarzab B (2010). "Mutaciones germinales de los genes RET, SDHB, SDHD y VHL en pacientes con feocromocitomas y paragangliomas aparentemente esporádicos". Endocrinología Polska . 61 (1): 43–8. PMID 20205103.
- Bailey SD, Xie C, Do R, Montpetit A, Diaz R, Mohan V, Keavney B, Yusuf S, Gerstein HC, Engert JC, Anand S (octubre de 2010). "La variación en el locus NFATC2 aumenta el riesgo de edema inducido por tiazolidinediona en el estudio de evaluación de la reducción de la diabetes con medicación de ramipril y rosiglitazona (DREAM)". Diabetes Care . 33 (10): 2250–3. doi :10.2337/dc10-0452. PMC 2945168 . PMID 20628086.
Enlaces externos
- Entrada en GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre síndromes de paraganglioma-feocromocitoma hereditario
- SDHD del Comité de Nomenclatura Genética de HUGO