Una propuesta en conflicto une a los perisodáctilos y los artiodáctilos en un clado llamado Euungulata.
[cita requerida] Los estudios moleculares posteriores generalmente no han podido respaldar la propuesta.
En particular, dos estudios filogéneticos recientes que analizan teorías alternativas para las relaciones entre mamíferos concluyeron que Zooamata y Pegasoferae no son grupos monofiléticos.
La propuesta competitiva que une a Perissodactyla y Cetartiodactyla en un clado llamado Euungulata, como hermana de Ferae (Fereuungulata), dentro Scrotifera recibió un fuerte apoyo.
[1][2] Eulipotyphla Chiroptera Perissodactyla Carnivora Pholidota Artiodactyla Otra filogenia controvertida obtuvo lo siguiente:[3] Eulipotyphla Chiroptera Artiodactyla Perissodactyla Pholidota Carnivora