Zoo Tycoon 2, a diferencia de su predecesor, Zoo Tycoon, tiene tres modos diferentes de juego: Es un modo de juego que nos lleva a completar campañas, cada una con escenarios con objetivos distintos, donde es indispensable ganar fama para disponer nuevos animales y objetos, y son más difíciles conforme avancemos, aquí se encuentran los tutoriales del juego.
Zoo Tycoon 2 tiene las siguientes características: Existen 10 diferentes biomedios: Hay cuatro modos de vista: fotográfico (para tomar fotos, se puede desplazar en primera persona con las flechas y agacharse con "X"), visitante (similar al primero, pero se pueden hacer las acciones de los empleados), cenital (donde compras objetos) y mapa general (mapa del zoo).
Además de varias expansiones usermade, hay muchos packs menores y muchísimas más descargas individuales, incluyendo algunos animales u objetos muy necesitados.
Los sitios de descargas más activos al momento son The Round Table y ZooHispania.
También hay expansiones user-made descargables como Miocene Madness, Formidable Seas, European Expeditions, South American Expedition, From the Past, Island Adventure y Cretaceous Calamity.