Mientras que la fauna béntica difiere entre lagos, especies de Chironomidae y Oligochaetae suelen dominar la fauna de la zona profunda porque poseen moléculas similares a la hemoglobina para extraer oxígeno del agua poco oxigenada.
[5] Los niveles microbianos en el bentos profundo son más altos que los del bentos litoral, posiblemente debido a que el tamaño promedio de las partículas de sedimento es más pequeño.
[6] Se cree que los macroinvertebrados bentónicos están regulados por una presión de arriba hacia abajo.
[7] Los flujos de nutrientes en la zona profunda son impulsados principalmente por la liberación del bentos.
La anoxia hipomnética también puede contribuir a la acumulación de hierro, manganeso y sulfuro en la zona profunda.