En 1768, de regresó, llevó dos oseznos blancos capturados en Groenlandia para el rey Luis XV.

Entre ambas misiones, había participado en una misión de inteligencia, durante 6 semanas, en Inglaterra, «para examinar, sin darse a conocer, la construcción naval de los ingleses...» («pour examiner, sans se faire connaitre, la construction navale des Anglais...»).

[2]​ Una tempestad separó a ambos barcos y Kerguelen prosiguió su ruta solo, abandonando al Gros Ventre.

A pesar de esta aventura, La Pérouse nos dice que Kerguelen fue recibido en Francia como un nuevo Cristóbal Colón [«il fut reçu en France comme un nouveau Christophe Colomb»].

(«Les terres que j'ai eu le bonheur de découvrir paraissent former la masse centrale du continent antarctique... la France australe fournira de merveilleux spectacles physiques et moraux...».)

Ambos estaban aparejados para una acción fundamentalmente expedicionaria y no militar, con una artillería reducida: el Rolland cargaba 36 cañones en lugar de los 64 habituales y el L'Oiseau 26 en lugar de 36.

Kerguelen había tenido la debilidad de embarcar a esta joven clandestina, de 14 años de edad, quien va a crear, según los términos del posterior consejo de guerra, «una rivalidad perjudicial para el bien del servicio, alterando la concordia que debe reinar en un navío y debilitando también el respeto debido a la autoridad» [«une rivalité préjudiciable au bien du service, en altérant la concorde qui doit régner dans un vaisseau et en affaiblissant même le respect dû à l'autorité»].

Kerguelen fue liberado en 1778, reintegrado a la Marina y se volvió a hacer al mar para actuar durante la guerra de América como corsario en la corbeta La Comtesse de Brionne.