Fue encargado por la Armada Imperial Japonesa tras comprobar las decepcionantes prestaciones estimadas del modelo R1Y.

La planta motriz del R2Y1, el Aichi Ha-70 se caracterizaba por ser la unión de dos motores, concretamente Aichi Atsuta, versión fabricada bajo licencia del Daimler-Benz DB 601.

Es remarcable que el diseño realizado por los alemanes en que se basaron los japoneses, el Daimler-Benz DB 606, acoplando dos DB 601 y empleado en los Heinkel He 177, también sufrió crónicamente problemas de recalentamiento e incluso incendios.

El vuelo de mayo fue el primero y último del R2Y1, dado que unos días más tarde, durante una pruebas estáticas el motor se incendió, y antes de que se pudiese sustituir, el aparato resultó destruido en un bombardeo estadounidense.

Al final de la guerra un segundo R2Y1 estaba en construcción y el diseño del R2Y2 casi completado.