Yerko proviene de una familia de clase media-alta vinculada a la política y ligada estrechamente al partido político del Movimiento Nacionalista Revolucionario (MNR).

Durante toda la década de 1990, participó en diferentes cursos de capacitación y formación en varios países del exterior como: Estados Unidos, Alemania, Colombia y Perú.

[8]​ Durante su vida laboral, Yerko Núñez se desempeñó como Director Nacional de Participación Popular en el año 2003.

Fue el alcalde más joven de Bolivia durante aquella época.

[10]​ Finalizado el período anterior, Yerko Núñez se postuló a su reelección dentro de la agrupación política Primero el Beni (PB), entonces liderada a nivel departamental por Ernesto Suárez Sattori.

[7]​ Núñez se postuló como senador por el Departamento del Beni en representación de la alianza política Unidad Demócrata (UD) junto con Jeanine Áñez que buscaba su reelección.[7]​.

Núñez ocupó ese cargo durante 20 días, y fue reemplazado por Iván Arias Durán.