A los 27 años, en 1993 se desempeñó como concejal de su municipio natal.
En 1997, durante el segundo gobierno de Hugo Banzer Suárez, Suárez fue posesinado como prefecto del departamento del Beni por el partido político de Acción Democrática Nacionalista (partido perteneciente al ex general y presidente de Bolivia Hugo Banzer Suárez).
[2] En 2002, Suárez es elegido diputado por el anterior partido mencionado para luego renunciar a su curul para postularse al cargo de prefecto del Beni por el partido Poder Democrático Social (PODEMOS), saliendo también electo, ocupando ese cargo desde enero de 2006 hasta abril de 2010.
Es así que en diciembre de 2011, la Asamblea Departamental del Beni, aprobó una acusación formal del Ministerio Público en su contra por lo cual, Suárez fue depuesto del cargo siendo su sucesor el asambleísta por el Movimiento Nacionalista Revolucionario Haisen Ribera Leigue.
Ernesto Suárez fue jefe también del partido Primero el Beni para luego pasa a ser candidato vicepresidencial del partido Unidad Demócrata con el objetivo de ganar las elecciones generales de Bolivia de 2014 junto a Samuel Doria Medina.