Adquirió el rico museo del conde de Pianura Francesco Grassi.La segunda parte de su colección se perdió en el naufragio del HMS Colossus durante su viaje a Gran Bretaña.Durante la mayor parte del tiempo de Hamilton como embajador, Nápoles había sido un remanso político.[6] En el verano de 1799, Nápoles fue reconquistada por los franceses y se decretaron represalias contra los que habían apoyado a la República Partenopea.Hamilton, junto con el rey y la reina y Nelson, permaneció en Palermo, a excepción de una breve visita a la bahía de Nápoles con el barco HMS Foudroyant.Dejó a Emma 800 £ al año, que incluyó 100 libras anueles para su madre, y pequeñas sumas anuales para sus cuatro sirvientes de Nápoles.Sus propiedades en Gales, que fueron fuertemente hipotecada, las heredó su sobrino Charles Francis Greville.A Nelson le dejó una copia del retrato de Emma pintado por Marie-Louise-Élisabeth Vigée-Lebrun.
