Pasó entonces a trabajar como profesor asistente de la Universidad Estatal Wayne (Detroit), donde permaneció entre 1962 y 1969.
Las críticas de Bunge le costaron ser considerado como simpatizante comunista por el gobierno[2], lo que truncó su progresión académica.
En 1968 organizó la Expedición Geográfica de Detroit en colaboración con Gwendolyn Warren, en 1971 la Sociedad para la Exploración Humana (Society for Human Exploration) y en 1971 la Expedición Geográfica de Toronto.
Por su parte Bunge comenzó a renegar del funcionamiento de las instituciones académicas.
Según Michael F. Goodchild, el seminario que Bunge impartía en la Universidad Western Ontario tenía un buen recibimiento por parte del alumnado, pero expresaba abiertamente su disgusto a las posiciones políticas de algunos de sus colegas académicos haciendo imposible que renovaran su contrato.
Bunge sostenía que los patrones geométricos plasmados en sus mapas urbanos expresaban una clara situación de desventaja e injusticia causados por el capitalismo moderno, problemas que podían ser solucionando aplicando métodos racionales.