El primer propósito de la Werwolf era actuar como una guerrilla o "resistencia armada" para atacar e interrumpir la logística, y moral de los ejércitos enemigos que avanzaban sobre suelo alemán, idea que formuló primero Martin Bormann y que fue secundada por Heinrich Himmler, quien logró el asentimiento de Adolf Hitler para este plan.
Las tácticas usadas por la organización consistían teóricamente en ataques de francotiradores, incendios, sabotaje y asesinatos, pero siempre en coordinación con el estado mayor de las tropas regulares situadas en un territorio determinado, por lo cual el "Werwolf" no estaba destinado a poseer la autonomía operativa de una verdadera guerrilla para elegir oportunidades y blancos, como hacían los partisanos que habían combatido los mismos alemanes en la Europa ocupada.
En las últimas semanas de lucha algunos jefes del Partido Nazi hicieron intentos desorganizados para enterrar explosivos, munición y armas en diferentes zonas del país, principalmente en la antigua frontera entre Alemania y Polonia, para ser usadas por la Werwolf en sus acciones de resistencia y sabotaje en caso de que la región fuera ocupada por el Ejército Rojo.
Pero no sólo las cantidades de material bélico escondido eran ínfimas para realizar algún sabotaje de importancia, sino que además el propio movimiento Werwolf estaba ya tan desorganizado que muy pocos de sus miembros sabían dónde estaban los "arsenales", menos aún conocían cómo usar las armas, o qué instrucciones seguir si se hallaban en territorio bajo ocupación enemiga.
Ante la confusión y la ausencia de órdenes concretas, numerosos reclutas del Werwolf simplemente abandonaron sus actividades y se unieron a la retirada masiva de las tropas regulares germanas hacia el oeste.
En el manga Hellsing, una organización secreta británica lucha contra un batallón nazi llamado Millennium, con sede en Brasil, que se exilió allí durante la caída del Tercer Reich en los últimos momentos de la Segunda Guerra Mundial.
Además, la introducción de la película exalta exageradamente las habilidades y el temor hacia estos soldados.