El piloto a los mandos fue identificado como Aleksii Vcherashnyi por Leonid Pogrebnyak, el Director de Aerosvit.

El vuelo continuó hacia Salónica, Grecia, a través del espacio aéreo ucraniano y búlgaro.

Según el equipo de investigación griego, esta fue la primera vez que la tripulación volaba a Salónica, y estaba nevando.

La tripulación del vuelo 241, sin embargo, malinterpretó esto y pensó que el descenso fue dirigido a ellos.

Más tarde solicitaron un rumbo, sin embargo su solicitud no fue escuchada por el controlador e inmediatamente contactaron con la aproximación de Salónica.

En lugar de volar al norte como les había indicado el controlador, el vuelo 241 puso rumbo oeste-suroeste y en consecuencia voló directamente hacia la ladera del Monte Pieria a 3.300 pies (1.006 m).

Los habitantes locales afirmaron haber visto un destello y oír el sonido de una explosión en la zona.

La operación de búsqueda y rescate llegó a ser detenida por las malas condiciones meteorológicas.

[11]​ Un reportaje no oficial de Associated Press sugería que la tripulación del vuelo 241 pudo haberse visto confundida mientras se comunicaba con los controladores aéreos debido a su pobre nivel de inglés.

[11]​ Los investigadores entonces se centraron en otros factores, como las malas condiciones meteorológicas y un posible error del piloto.

Aparentemente, la tripulación nunca había sido instruida o entrenada para una aproximación al aeropuerto de Salónica.

[12]​ El avión no siguió el «arco», como habían sido instruidos por el controlador aéreo, procediendo en su lugar directamente a THS/NDB.

La tripulación tampoco aportó un informe de posición como les había indicado el controlador aéreo.

[12]​ El capitán entonces solicitó a sus compañeros de tripulación que requiriesen al controlador vectorización radar.

Esto limitó su capacidad para transmitir y asimilar la situación tan crítica que se estaba desarrollando rápidamente.

Cada miembro de la tripulación intentaba en solitario solucionar el problema al haber perdido la consciencia situacional y del terreno.

Los pilotos compartían sus pensamientos pero pese a diferir los unos de los otros estos seguían siendo incorrectos.

[12]​ Durante la confusión, la alarma de proximidad al terreno sonó tres veces.

Entonces sonó la cuarta alerta, y en este momento el capitán se percató de que volaban muy cerca del terreno.

El capitán intentó evitar el inminente desastre comenzando a elevar la nariz, pero ya fue demasiado tarde.