Los sitios de ocupación prehispánicos (antes de la conquista) se ubicaron sobre pequeños abanicos de vertiente, desde los cuales dominaron el paisaje y tuvieron una observación permanente de sus referentes geográficos como el nevado del Tolima, la cordillera Central y el valle medio del río Magdalena, lo cual permite deducir relaciones culturales y comercio con comunidades del valle de ese río y el suroccidente del país.

[3]​ Los españoles conocedores de las inmensas riquezas en oro de estas gentes se establecieron allí como colonos.

En el año 1729 fue terminado el templo que hoy existe siendo el primer cura párroco Pbro.

El Municipio de Valle de San Juan está integrado por un suelo fértil, en el cual se denotan valles y llanuras y en el que se pueden ver extensos cultivos de maíz; su principal producto agrícola.

También se encuentran ríos y quebradas que acompasan el paisaje, con un bosque de mediana altura.