Durante la Edad Media Valer quedó integrado en el Reino de León, cuyos monarcas habrían acometido la repoblación de la localidad dentro del proceso repoblador llevado a cabo en Aliste.
[5] Existía una ermita donde actualmente se encuentra la iglesia nueva, esta última inaugurada en el año 1961.
La iglesia antigua era parecida a otras que todavía se conservan en los pueblos de la zona como Fornillos, Flores, Lober,...etc.
Hoy día se hubiera reparado, como han hecho con otras y tendríamos un pequeño monumento bastante valioso en Valer.
Junto a ella había un pequeño cementerio, pero como resultaba insuficiente construyeron el actual, que muchos de nosotros siempre hemos conocido.