La cultura olmeca se desarrolló desde el Preclasico alrededor del año 2500 a. C. al 400 a. C. El sitio está situado cerca del cerro de la Estrella en las montañas donde también están sitios como La Venta, San Lorenzo y Laguna de los Cerros.

La primera cabeza de estilo olmeca fue descubierta por José Melgar en Tres Zapotes en 1862.

También, se cree que dichas variantes pudieron haber conducido a la escritura maya.

En el otro lado está la fecha en numeración maya más antigua hasta el momento descubierta.

Esta fecha, 7.16.6.16.18, se corresponde en el calendario actual al 3 de septiembre del 32 a.

En el museo se puede encontrar una exhibición permanente de piezas que fueron elaboradas por la cultura madre, entre ellas cabezas colosales, estelas, tiestos, etc.

En 1906 Eduard Seler volvió a confirmar la existencia de una cabeza colosal, la reportada por José Melgar.