Cabe destacar que hubo una ampliación de equipos participantes en este torneo, ya que en la anterior temporada fueron 57 equipos distribuidos en 8 grupos, este cambio se realizó para promover el desarrollo del fútbol en más zonas del país.
Se perdonó el descenso del torneo anterior a los equipos AD.
Fortuna FC y se unieron 19 equipos que ganaron su ascenso en la Tercera División de LINAFA 2016-2017.
El campeón fue AD Golfito Zona Sur, que ganó en la tanda de penales 5 por 4 al Desamparados FC.
Adicionalmente los equipos peor ubicados en cada grupo de la Primera Fase, participarán en Series por el No Descenso.
AF Lankester 1943 obtuvo mejores resultados en sus duelos particulares con el Municipal Guarco
Ciudad Colón no tuvo disponible la cancha a tiempo para disputar esta jornada.
Sarchí debido a que Sporting JK no tuvo disponible la cancha para disputar esta jornada.
Siquirres se presentó al juego de reposición con sólo 7 jugadores.
[11] Atlético Coco obtuvo mejores resultados en sus duelos particulares contra La Colmena (CCDR Carrillo)
Cuajiniquil se retiró del torneo debido a que la Tormenta Tropical Nate destruyó la cancha de su comunidad y dañó los implementos deportivos como los uniformes.
(*): Sancionado por incomparecencia en un partido(**) Equipo se retiró del Torneo por problemas económicos
Bambel Zona Sur desciende a la Tercera División de Linafa 2018-2019.
Bambel Zona Sur no canceló el monto correspondiente al arbitraje.
Esta fase se enfrentan en series directas los 10 equipos clasificados de la ronda anterior, para obtener los 6 equipos que clasificarán a la siguiente etapa (los 5 ganadores de las series y adicionalmente el mejor perdedor).
Nota: Municipal Atenas clasifica como Mejor Perdedor a la siguiente fase.
En esta temporada se implementó jugar dos triangulares semifinales, y el ganador de cada triangular avanza a la Final.
(*) Desamparados FC se clasificó a la Final del Torneo desde la Fecha 4.
(*) Desamparados FC se clasificó a la Final del Torneo desde la Fecha 4.