[1]​ La organización está a cargo de la ANFP.

Los clubes se dividirían en 2 grupos, zona centro y zona sur, se jugará en modalidad de todos contra todos, y a diferencia de los anteriores torneos de apertura este se llevará a cabo en una rueda, clasificando a etapa de playoff los mejores 4 clubes ubicados en la tabla de cómputo general.

Las llaves de playoff estarán compuestas de la siguiente manera: Primero Centro vs Cuarto Sur; Primero Sur vs Cuarto Centro; Segundo Centro vs Tercero Sur y Segundo Sur vs Tercero Centro.

= Posición; PTS = Puntos; PJ = Partidos Jugados; PG = Partidos Ganados; PE = Partidos Empatados; PP = Partidos Perdidos; GF = Goles a favor; GC = Goles en contra; DG = Diferencia de goles Terminada la fase clasificatoria, los 4 mejores equipos de las dos zonas accederán a playoffs para disputar el título del campeonato de apertura 2016.

Los cuartos de final, semifinales y final se jugarán en un solo partido, jugando de local el equipo que haya obtenido el mejor lugar en su grupo durante la fase regular del campeonato.