La formación original apareció por primera vez en The Incredible Hulk #449 (enero de 1997), creada por Kurt Busiek y Mark Bagley.
[16] En julio de 2023, se anunció una nueva serie Thunderbolts y la nueva alineación del equipo estará dirigida por el Soldado del Invierno y la Contessa Valentina Allegra de Fontaine y estará compuesta por superhéroes con temas de espionaje, incluidos la Viuda Negra, Sharon Carter, Viuda Blanca, Guardián Rojo, U.S.
En su primera aparición en The Incredible Hulk #449 (enero de 1997) combatían a Hulk, para después pasar a tener su propia serie regular donde lucharían contra unos saqueadores llamados Las Ratas y contra la Brigada de Demolición.
Jolt ignoraba la verdadera naturaleza de los Thunderbolts, que debían interpretar sus papeles todo el tiempo, incluso frente a ella.
La mayoría de Thunderbolts se veían atraídos por la idea de ser un héroe y Zemo reveló la verdadera naturaleza del grupo, para que todos supieran que eran villanos y los Thunderbolts se mantuvieran fiel a él.
[21] Más adelante Meteorito recuperó su antiguo nombre en clave, Moonstone, y reveló que nunca quiso redimirse.
Esta etapa estuvo marcada por la descofianza que hubo entre los miembros del equipo, principalmente entre Moonstone y Songbird.
[28] Al ser encarcelado Norman Osborn, Steve Rogers cita a Luke Cage en La balsa y le encarga que lidere y forme un nuevo grupo de Thunderbolts con la idea original de criminales que buscan redimirse.
Una vez formado el grupo Luke Cage les pone a prueba para ver si están de su lado.
En su primera misión van a Asgard para enfrentarse a unos troles, uno de los cuales resulta ser Gunna, una asgardiana que había sido raptada cuando era una niña y creía ser una trol, al tener fuerza sobrehumana es encerrada en la balsa, aunque más tarde se uniría al grupo.
Con la ayuda del Doctor Extraño descruben que Hiperión estaba afectada por magia maligna y Luke Cage decide reclutar a Satana como experta en artes mágicas para el equipo.
[30] Un comité ejecutivo del gobierno decide aprobar un segundo equipo de Thunderbolts con Pájaro Cantor como líder.
[36] El grupo homónimo estará formado por Yelena Belova (Florence Pugh), Bucky Barnes (Sebastian Stan), Guardián Rojo (David Harbour), U.S.
Agent (Wyatt Russell), Fantasma (Hannah John Karmen) y Taskmaster (Olga Kurilenko).
El equipo está fundado por Valentina Allegra de Fontaine (Julia Louis-Dreyfus).