[1] Cech pertenecía a una familia de origen checoslovaco.
Su padre, que era médico y aficionado a la física.
Nacido en Chicago, su infancia transcurrió en la ciudad de Iowa y descubrió por sí mismo la ciencia cuando en cuarto curso comenzó a coleccionar minerales y rocas, preguntándose por su proceso de formación.
En dicho colegio, conoció a la joven Carol Lynn Martinson, con quien acabaría compartiendo su vida.
y posteriormente realizó su doctorado en la Universidad de Berkeley en 1975.