Practicó la autopsia a Marilyn Monroe, Robert F. Kennedy, Sharon Tate y demás víctimas de los asesinatos Tate-LaBianca, Albert Dekker, Janis Joplin, Gia Scala, William Holden, Natalie Wood, y John Belushi.
En 1967, se convirtió en el médico forense jefe del Condado de Los Ángeles (CME), reemplazando a su mentor, Theodore Curphey.
Como tal, Noguchi centró la atención pública por una serie de autopsias que efectuó o supervisó en una serie de celebridades y figuras públicas que incluyen a Albert Dekker, Robert F. Kennedy, Sharon Tate, Janis Joplin, Inger Stevens, Gia Scala, David Janssen, William Holden, Natalie Wood, Marilyn Monroe y John Belushi.
Un antiguo interno de Noguchi en la época declaró que vio moratones compatibles con ser empujado desde una embarcación.
Desde 2017, Noguchi es el presidente de la World Association for Medical Law (WAML), que es un organismo médico fundado en 1967 para fomentar el estudio del derecho a la salud, la medicina legal y la bioética.