El nombre de la Villa de San Sebastián de Tenerife, se debe a una costumbre española en la que al fundar una población se le daba el nombre del Santo que ese día celebraba la Iglesia y casualmente ese día se celebraba el martirio de San Sebastián.
En este afán, sobre un elevado promontorio sitio en la ribera oriental del Río Grande de la Magdalena, Francisco Henríquez descuajó la manglaria para edificar capilla y consistorio civil, trazó calles encrucijadas y montó alabardas defensivas.
Por sus heroicos destinos, su importancia humana, comercial, geográfica y política, el nombre de Tenerife se usó para denominar a una provincia del Estado Federal del Magdalena en 1857, y 1864 en un departamento.
Uno de sus gobernadores fue don Gabriel Antonio Briceño quien, en abril de 1868, oficiaba como tal cuando falleció en Tenerife, Anne Lenoit, la amantísima del Libertador Simón Bolívar.
El actual Alcalde municipal es Jorge Mercado Botero (2024-2027), elegido por voto popular.