[3] El club dejó libre a Holden luego de seis meses y ningún partido jugado con el primer equipo.
Hizo su debut con el club el 27 de mayo en el empate 1-1 contra el New England Revolution.
En los años posteriores Holden se afianzaría como una de las estrellas del equipo, llegando a jugar 116 partidos con los texanos y anotando 22 goles.
[10] Hizo su debut en la Premier League tres días después, jugando los noventa minutos en la victoria 1-0 sobre Wolverhampton Wanderers.
El 20 de septiembre, luego de estar fuera por seis meses, Holden volvió a jugar un partido con el Bolton, jugando los noventa minutos del encuentro contra el Aston Villa por la tercera ronda de la Copa de la Liga,[17] pero poco después se determinó que estaría fuera por otras seis semanas ya que fue necesario que se someta a otra operación complementaria.
[18] Sin embargo, la operación reveló daño en el cartílago, dejando fuera al estadounidense por otros seis meses.
[20][21] Un poco más de un mes después, el 6 de diciembre, su club anunció que finalmente había regresado a los entrenamientos regulares con el primer equipo, aunque sólo día por medio.
[27] Al retornar, el club anunció que había ofrecido una extensión de contrato al estadounidense, ya que su afiliación con los Wanderers terminaba a finales de la temporada.
[38][39] Holden jugó su primer encuentro internacional luego de su lesión ingresando en el segundo tiempo del partido amistoso que Estados Unidos perdería 4-2 ante Bélgica.
[41] Holden continuó jugando regularmente en el torneo y fue titular en la final ante Panamá el 28 de julio, pero debió salir del partido a mediados del primer tiempo luego de sufrir una nueva lesión en la rodilla derecha.