Para muchos es considerado el primer juego de la "Soul Blazer Trilogy", seguido por Illusion of Gaia y Terranigma.

En Soul Blazer el jugador controla a Blazer (en japonés Blader), un ángel enviado por Dios para reconstruir el mundo destruido por Deathtoll (en japonés "Destor") quien ha capturado las almas de todos los seres vivos del planeta.

El jugador debe liberar a varias ciudades luchando contra monstruos en típicas batallas de mazmorras.

Dr. Leo, que aún se encontraba en la prisión del castillo del rey Magridd, es liberado por el héroe y pierde su vida al asesinar a la reina, que aún trataba de hacer negocios con Deathtoll.

Sin embargo, un año después, dándose el Maestro cuenta de que el guerrero anhelaba su vida humana, decide devolverle al Imperio Freil bajo la condición de que olvidase su pasado.