Sonic Origins agrega modos de juego y misiones adicionales, que permiten a los jugadores desbloquear contenido en un museo dentro del videojuego.
[3][4] Sonic Origins presenta dos versiones de cada videojuego: el "modo Clásico" es el formato original, presentado en una relación de aspecto 4:3, mientras que el "modo Aniversario" cuenta con soporte para pantallas panorámicas y elimina las vidas.
[3] Un "modo Historia" permite a los jugadores jugar los cuatro videojuegos en secuencia, con nuevas escenas animadas.
Jugar en estos modos le permite al jugador ganar monedas y comprar contenido en un museo dentro del videojuego o intentos adicionales en etapas especiales.
[1] Los jugadores que reserven el juego comenzarán con 100 monedas y el modo Espejo desbloqueado.
Debido a que la película atrajo a muchos fanáticos nuevos, el jefe de Sonic Team, Takashi Iizuka, quería que los videojuegos antiguos de Sonic estuvieran disponibles en formatos modernos.