La Génesis siguió la red interplanetaria de transporte de trayectoria complicada a una órbita caótica del halo de Lissajous en el L1 punto de Lagrange entre la Tierra y el Sol.
El 8 de septiembre de 2004, la cápsula realizó su reentrada en la atmósfera mientras que el resto de la nave espacial derivó hacia una órbita irrecuperable.
Debido a un defecto de diseño en un sensor de la desaceleración, el despliegue del paracaídas no se accionó, y la nave espacial descendió frenando únicamente por acción de la resistencia del aire.
La operación prevista de recuperación no podía ser realizada.
La nave espacial se estrelló irremediablemente en el suelo a 86 m/s (311 km/h) en la base militar del desierto de Dugway (polígono de pruebas del ejército de Estados Unidos), a unos 50 km al oeste de la localidad de Dugway (en el condado de Tooele), a unos 120 km al suroeste de Salt Lake City (estado de Utah).