Durante la Segunda Guerra Mundial, Toyoda fue el tercer Comandante en Jefe de la Flota Combinada después de Yamamoto, las intrincadas operaciones tácticas navales denominadas Victoria (Go en japonés) que planificó y/o autorizó al final del Frente del Pacífico, fueron graves derrotas que condujeron a la aniquilación del poderío remanente de la Armada Imperial Japonesa.
Se graduó con honores en la Escuela Naval de la Armada en 1915, y fue ascendido a teniente comandante en 1917.
Un año después, acompañó al almirante Isoroku Yamamoto a la Conferencia Naval de Londres.
Desde el primer momento, Toyoda se opuso firmemente a la guerra con los Estados Unidos, admitiendo que era "imposible de ganar".
Siguió con la "Operación Sho-Gō", que nuevamente resultó en otra gran derrota en la batalla del Estrecho de Surigao.
Al final, sin embargo, la agresiva defensiva estratégica de Toyoda no dio resultado.
No obstante, Toyoda continuó con la misma estrategia aprobando la "Operación Ten-Gō", que consistía en enviar al acorazado Yamato en su misión solo de ida a Okinawa.
A pesar de estas derrotas decisivas, Toyoda se mantuvo en su cargo.