La organización y atribuciones del Servicio Electoral están establecidas en una ley orgánica constitucional.

Su forma de desconcentración, las plantas, remuneraciones y estatuto del personal están establecidos en una ley.

[19]​ La repartición se instaló en su sede definitiva en Esmeralda 611; inicialmente ocupaba solo los pisos 6 y 7 además del subterráneo, mientras que en enero de 1987 se le asignaron los demás pisos, ocupando el inmueble en su totalidad.

Hasta enero de 2012 el director nacional ejercía la dirección superior exclusiva del Servel.

El Servicio Electoral se encuentra dividido administrativamente en tres subdirecciones y territorialmente en 16 direcciones regionales:[33]​