A fines de 1218 era una ciudad libre del Sacro Imperio Romano Germánico.

En 1944 Schaffhausen fue bombardeado erróneamente por los estadounidenses, al confundir el territorio suizo con el alemán.

En el cantón la producción del vino blanco de Riesling es renombrada.

La industria está basada en la producción de maquinaria y artículos metálicos.

Schaffhausen es asimismo un importante nudo ferroviario entre Suiza y Alemania.