El papa Pascual I, a quien se atribuye la época de renovación y esplendor artístico que ocurrió en Roma a principios del siglo IX, reconstruyó la iglesia en 818-822, proporcionándole una destacada decoración de mosaico.
Una interpretación es la derivación de dominicum, que significa «del Señor», y por extensión «iglesia».
El cardenal diácono del titulus de Santa María en Domnica es William Joseph Levada.
El papa León X renovó la iglesia en 1513-1514, Andrea Sansovino dirigió las obras e incluyó el pórtico de la fachada con columnas toscanas.
El techo está pintado al fresco por Perin del Vaga, basándose en diseños de Giulio Romano.