La primera parte, San Juan, se refiere al patrón de la parroquia del lugar.Es, por tanto, emparentada con uno de los antiguos cultivos más abundantes en la comarca, y que ha dado muchos otros topónimos pallareses.Joan Coromines lo deja bien claro al establecer su etimología (op.La iglesia del pueblo, de origen románico pero muy transformada, está dedicada a San Juan.El mismo Bellmunt recoge también las partidas pertenecientes al pueblo de San Juan de Viñafrescal: Aubaga, Bancalada, Barranc del Solà, Capsor, Colomina, Comú, Costa, la Crua, Estrada, Ginjoli, Guitarra, Macaleu, Mossèn Blasi, Oliverada, Pla de Sanaüja, Pla de Sidi, Plans, Rengar, Salaneta, Santa Llúcia, Sant Antoni, Segalins, Sindreu, Tallades de Matacabrits, Torrents y Tros Gran.
Arco del extremo norte de la población de San Juan de Viñafrescal.
