El municipio de San Francisco alcanza su mayor auge económico cuando funcionaba la compañía bananera estadounidense Vaccaro Bros Society.

En 1950 fue construido el primer edificio y reconstruido en el año 1982 siendo alcalde municipal el señor Marshall Hall.

Las autoridades en su mayoría han sido originarias de Santa Ana y San Francisco.

La misma funcionó donde hoy es el centro social el cual en los años ochenta y noventa del siglo XX, era el "Instituto San Francisco de Asís".

El casco urbano de la cabecera Municipal consta de 8 barrios y 6 colonias, siendo Barrio el Parque el más antiguo pues data del año 1903, constituyendo el centro del pueblo y donde se ubicaba la iglesia, el parque central y las antiguas oficinas municipales.