En los primeros días de la guerra, la población checa participó en el boicot al transporte público y se hicieron llamamientos esporádicos para manifestarse masivamente.
En el contexto de la persecución alemana, los grupos de resistencia importantes consolidaron sus filas en el marco del Central Leadership of Home Resistance (Ústřední vedení odboje domácího, ÚVOD).
Sin embargo, ÚVOD era conocida por transmitir informes inexactos, ya fuesen datos de inteligencia falsos o actualizaciones militares.
La ÚVOD logró cambiar la postura oficial de Beneš sobre este tema.
Los líderes de la KSČ simpatizaban con la ÚVOD ayudando a mantener las relaciones soviético-checoslovacas.
Según sus memorias, inmediatamente pasó esa información a norteamericanos, británicos y soviéticos.
En octubre de 1942, 1.331 personas fueron condenadas a muerte por los tribunales alemanes del Protectorado.