En estos últimos años él ganó una beca para ir a realizar sus estudios superiores en la Universidad de Chile.
Posteriormente, desde 1965 hasta 1968 vivió en la República Checa y allá ocupó el cargo de editor en la revista internacional comunista otazku miruv socialismus para la publicación en español.
Después de su estadía en Praga, Ramiro Otero regresó a Bolivia y abogó por una reconstrucción de la verdad histórica para mejorar la imagen del partido, una postura que le ganó simpatía entre los jóvenes.
Dicho comunicado fue publicado sin consultar con ningún organismo dirigente del partido como una reacción a inmediata al conocer El Diario del Che y, en particular, la "Introducción Necesaria" de Fidel Castro, en los que Ramiro Otero junto con Mario Monje y otros miembros del partido son tildados de traidores a la guerrilla.
Al día siguiente, Jorge Kolle Cueto, dirigente máximo del PCB, emitió otro comunicado desautorizando a Otero y declarando que sus opiniones no reflejaban el criterio de la dirección del partido.
No obstante, Otero siguió escribiendo bajo el seudónimo de Benjamín Méndez, criticando la táctica guerrillera y promoviendo una acción partidaria independiente.
En 1980 subió al poder el dictador Luis García Meza, durante aquel gobierno Ramiro Otero colaboró como periodista en el periódico Aquí del padre español Luis Espinal Camps que fue torturado y asesinado por la dictadura, debido al periódico que él publicaba para denunciar las atrocidades de aquel gobierno de facto.
Ramiro Otero realizó un habeas corpus para denunciar esta atrocidad pero eso le costó haber sido perseguido, ser objeto de un atentado bomba en aquel periódico del que se salvó, fue torturado y fue tomado preso por el ejército boliviano.
[2] Luego, llegó a ser Rector interino durante las elecciones del Rectorado de aquella Universidad, tuvo la oportunidad de darle el doctor honoris causa al expresidente cubano Fidel Castro en 1989.
Ramiro Otero hizo varias contribuciones académicas como autor de trabajos relacionados con el derecho procesal penal.
[4] También fue presidente de la ONG ambiental "Fobomade" durante las gestiones 2011 y 2012, allí encabezó la "VIII Marcha" indígena por la defensa del TIPNIS y en contra de la acción determinacíon del gobierno boliviano en la que se construiría una carretera para que atravesar este territorio sin tomar en cuenta el impacto ambiental y faltando a los derechos de sus habitantes, y además, según él, velando por intereses de algunos sectores "cocaleros" e inversiones extranjeras.