Regresó al Brasil en 1886 y se hizo socio de una importante casa comercial con el señor Dani da Silva.
Durante el Imperio participó del Club Rio Branco, en los años en que actuó en la campaña abolicionista contra la esclavitud.
En varias oportunidades personalmente compró esclavos a quienes otorgaba la libertad y plenos derechos pocas horas después.
Durante esta guerra, Rafael Cabeda tuvo actuación directa en el ejército revolucionario y combatió en diversos frentes de batalla.
Al concluir el conflicto, participó de varios congresos federalistas con Gaspar da Silveira Martins y de la comisión organizada para aprobar el proyecto del Partido Federalista, esa comisión aprobó los estatutos en 1901 y Rafael Cabeda fue elegido para integrar el directorio central del Partido Federalista.