Todo el tramo del río que se encuentra en Maine es, esencialmente, una vía fluvial natural navegable.

), el río Saint John comienza a formar parte de la frontera internacional entre Maine (MA) y Nuevo Brunswick (NB).

El río continúa su discurrir hacia el nordeste pasando frente a Fort Kent (MA, 4233 hab.)

Vira al sureste y a continuación pasa entre las localidades de Van Buren (MA, 2631 hab.)

), el río entra enteramente en Canadá, en la provincia de Nuevo Brunswick y cambia de dirección, hacia el sur, discurriendo a través del fértil valle alto del río Saint John (Upper St.

), el río es cruzado por el puente cubierto más largo del mundo (ver imagen).

Después de pasar la presa Mactaquac (1968) el río continúa hacia el este hasta llegar a Fredericton (NB, 50 535 hab.

Estas mareas son las más altas del mundo y hacen que el río invierta su flujo dos veces al día por un estrecho desfiladero en el centro de la ciudad.

Los acadienses se establecieron a lo largo del curso bajo del río durante los siglos XVII y XVIII, en lugares como Fort la Tour (Saint Jean) y Fort Sainte-Anne (Fredericton).

Los asentamientos ingleses en el valle alto no se producirían hasta la primera mitad siglo XIX.

Ese deshielo primaveral puede resultar desastroso, con frecuentes inundaciones a lo largo del río.

Tanto ciudadanos estadounidenses como británicos se asentaron en la zona y, dado que la frontera internacional en esta región estaba poco definida, el conflicto entre la colonia británica de Nuevo Brunswick y el estado de Maine, inevitablemente, estalló.

La guerra de Aroostook (1838-39) se desarrolló cuando las respectivas tropas fueron movilizadas, pero, afortunadamente, el conflicto fue incruento.