Nace a unos kilómetros al norte de Molina, por la confluencia del río Colorado (Lontué) y del río Patos de San Pedro o también conocido simplemente como el río de Los Patos.
El río Lontué, drena la parte sur de la cuenca del Mataquito.
Sin embargo existe también una influencia pluvial en los meses de invierno.
El caudal del río (en un lugar fijo) varía en el tiempo, por lo que existen varias formas de representarlo.
Esto quiere decir que ese mes se han medido igual cantidad de caudales mayores que caudales menores a esa cantidad.