El nombre en idioma maya de esta localidad era Holkoben, mismo que se usó durante mucho tiempo después de la conquista por parte de los españoles.

[8]​ La localidad de Río Lagartos se encuentra en la región denominada litoral norte del estado de Yucatán, 165 km al oriente del puerto de Progreso.

A medida que avanzaron hacia el interior, se dieron cuenta de la gran cantidad de cocodrilos que había, y lo nombraron como Río de los Lagartos.

[8]​ Se sabe que había población maya antes de la conquista de Yucatán en toda la región, que perteneció al cacicazgo o jurisdicción de Chikinchel.

La zona de manglares de Río Lagartos y la reserva ambiental protegida cercana, denominada Ría Lagartos, constituye un ámbito natural que atrae una gran cantidad de turistas locales y extranjeros principalmente europeos y en menor medida estadounidenses y latinos.