Nace en la laderas norte de los cerros "La Copa" y "El Altar" que son a su vez el límite norte de la cuenca del río Mapocho.
Luego se dirige hacia el noroeste a través de 15 km, con gran pendiente y recibe las aguas de su principal afluente, el río Leones.
Según una carta oficial, el Aconcagua nace recién en la confluencia del Juncal con el río Colorado.
El caudal del río (en un lugar fijo) varía en el tiempo, por lo que existen varias formas de representarlo.
Esto quiere decir que ese mes se han medido igual cantidad de caudales mayores que caudales menores a esa cantidad.