[4]​ El puente fue reubicado respecto a su posición original cuando se construyó la presa de Alcántara.

Hay otros puentes en arcos segmentarios romanos como el Ponte San Lorenzo en Padua.

[7]​ La N-630, la A-66 y una línea de ferrocarril, al cruzar el Tajo por allí cerca, hicieron desaparecer la importancia que históricamente había tenido este puente para unir el norte y el sur de España.

[16]​ Hay algunas evidencias de que una comunidad llamada Alconétar, Alconétara o Alcontra (en árabe: "puente pequeño") existió al menos temporalmente —probablemente una referencia indirecta al Puente de Alcántara—.

[18]​ De acuerdo con otra teoría, el agua podría haber empezado a erosionar el puente en aquella época.

[19]​ Sobre 1340, sin embargo, el puente estaba aparentemente inutilizable otra vez, de manera que se estableció una barca para cruzar el río, de la cual se vuelve a hablar en referencias posteriores.

Este último plan del ingeniero militar José García Galiano incluía una reconstrucción completa con tres arcos rebajados de vano ancho.

[10]​ El esbozo de construcción hecho por Rodríguez (ver dibujo más abajo) muestra el perfil del puente, aumentando uniformemente y dominado por tres arcos centrales en el centro del río.

Aunque se trataba de un intento serio de reconstruir el puente lo más parecido posible al original, el erudito español Durán señala que ligeros cambios en el cuerpo principal no podrían ser evitados en un trabajo tan difícil.