Durante su formación, esta enzima añadía grupos hidroxilo (OH-) a los aminoácidos prolina presentes en la molécula de colágeno.

Este proceso resultó ser esencial para obtener una proteína funcional, lo que destacó la importancia de la enzima prolil 4-hidroxilasa (P4H) como un componente fundamental en esta modificación postraduccional.

[1]​ Posteriormente, se empezaron a investigar otras variantes de la P4H que estuvieran implicadas en la regulación del HIF.

Mediante estudios en ratones y análisis moleculares, se lograron determinar algunas de funciones específicas, así como su papel en procesos celulares clave, como la angiogénesis y la regulación de la homeostasis del calcio.

[1]​ Aún así, todavía queda mucho por descubrir sobre esta proteína, y actualmente se están llevando a cabo experimentos para identificar con mayor precisión sus funciones y los procesos en los que resulta esencial.

Un ejemplo destacado es su posible implicación en la obesidad mórbida, particularmente en población infantil, asociada a un mal funcionamiento de esta proteína, o tener un papel clave en la regulación emocional.

[2]​ La proteína prolil 4-hidroxilasa transmembrana (P4HTM), se localiza principalmente en el lumen del retículo endoplasmático (RE).

[3]​ Saber que parte del cuerpo cuenta con más proporción de la proteína P4HTM, ayuda a poder seguir investigando y descubriendo sus funciones, porque estas estaran relacionadas con la ubicación donde se encuentre.

[5]​ El dominio EF cuenta con dos motivos de unión al ion calcio (Ca2+).

Estos motivos podrían inducir reacciones bioquímicas en detectar cambios en la concentración de calcio en la célula.

A pesar de esto, se han podido determinar ámbitos en los cuales podría actuar o tener relación.

Por lo tanto, desempeña un papel en la adaptación a la hipoxia y podría estar también relacionada con la detección de oxígeno.

Por este motivo se cree que puede influir en mecanismos neuroquímicos de esta área.

[9]​ La prolil 4-hidroxilasa transmembrana (P4HTM) cataliza la formación de 4-hidroxiprolina en una proteína llamada factor inducible por hipoxia 1-alfa (HIF1A).

En concreto, añade los grupos hidroxilo en las localizaciones "Pro-402" y "Pro-564" dentro del dominio de la degradación oxígeno-dependiente (ODD).

[13]​ La reacción química que rige la actividad enzimática de la prolil 4-hidroxilasa transmembrana es la siguiente:[14]​

No obstante, dado que la ausencia del gen P4HTM afecta gravemente al desarrollo cognitivo, su inactivación solo se considera viable en sujetos adultos.

Las principales son las prolil hidroxilasas de colágeno y las HIF (factor inducible por hipoxia).

Estas incluyen hipotonía, hipoventilación, deterioro del desarrollo intelectual, disautonomía, epilepsia y anomalías oculares.

Aunque no se observa en la estructura cristalina, el extremo C-terminal de la proteína P4HTM contiene una señal de retención en el RE, y su pérdida podría hacer que ésta avanzara más allá del RE en la vía secretora.

[33]​ Al igual que GATA3, P4HTM presenta una mayor expresión de ARN mensajero y proteína en tumores luminales, y su alta expresión está asociada con una mejor supervivencia de las pacientes.

Se necesitan más estudios para esclarecer los mecanismos mediante los cuales GATA3 y P4HTM influyen en las características del cáncer de mama.