Por ejemplo, leyes municipales que impliquen diversos impuestos provocarán inevitablemente cambios económicos en regiones distantes.

La Ley Orgánica del Municipio y el actual Plan Director de la ciudad determinan, sin embargo, que la administración pública debe garantizar a la población herramientas efectivas para manifestar la democracia participativa, lo que genera que el municipio esté dividido en subprefecturas, cada una liderada por un subprefecto designado por el alcalde.

[2]​ El Poder Legislativo está representado por la Cámara Municipal, formada por 55 concejales elegidos para cargos de cuatro años.

Sin embargo, a veces se cuestiona el funcionamiento efectivo y la representatividad de estos consejos.

Dos partidos se alternaron en el gobierno durante la década de 1990 (el período inmediatamente posterior a la dictadura militar, en el que los alcaldes eran nombrados invariablemente por el Ejecutivo Federal), el PT de las alcaldesas Luiza Erundina (1989 - 1992, hoy en el PSOL) y Marta Suplicy (2001 - 2004) y el PP (antes PPB) de Paulo Maluf (1993 - 1996) y su ahijado político Celso Pitta (1997 - 2000).

En 2004, la entonces alcaldesa Marta Suplicy (PT) se presentó a la reelección contra Erundina, Maluf y el exministro de Planificación y Salud José Serra (PSDB), así como una serie de candidatos menores.

Su vicepresidente, Gilberto Kassab, del DEM (antiguo PFL), reelegido en 2008, asumió el cargo.