La prefectura apostólica del Congo Inferior (en latín: Praefectura Apostolica Congi Inferioris y en portugués: Prefeitura Apostólica do Baixo Congo) fue una circunscripción eclesiástica latina de la Iglesia católica en África, sede inmediatamente sujeta a la Santa Sede.
Después de las modificaciones del siglo XIX, en particular las de 1886, su territorio quedó limitado únicamente a las fronteras del Congo portugués (África Occidental Portuguesa).
[4] El decreto también menciona a los primeros misioneros capuchinos enviados a África: el prefecto apostólico Buenaventura de Alessano, asistido por los frailes Giuseppe de Milán, Giovanni Francesco di Cittaducale y Bonaventura di Torella.
[7] Sin embargo, las guerras en Europa, la Revolución francesa, las guerras napoleónicas, y la supresión de las congregaciones religiosas, pusieron en crisis las misiones africanas, y de hecho la prefectura apostólica del Congo fue abandonada.
[8] Sólo en la segunda mitad del siglo XIX la Santa Sede pudo confiar la prefectura apostólica a una nueva congregación religiosa, después de que los capuchinos manifestaran su incapacidad para continuar la misión.