Es un sólido cristalino blanco e higroscópico que es altamente soluble en agua y en alcohol.
Usualmente se presenta como el monohidrato, que tiene una estructura cristalina rómbica.
El NaClO4 encuentra un uso, aunque mínimo, en la pirotecnia, debido a que es higroscópico.
El NaClO4 presenta diversas aplicaciones en los laboratorios, normalmente como electrolito no reactivo.
Por ejemplo, se emplea en la extracción estándar del ADN y en reacciones de hibridación en biología molecular.