Pelagonia (en griego antiguo: Πελαγονíα o Pelagonía; en macedonio: Пелагонија o Pelagonija), era una región de la Grecia Antigua, posteriormente incorporada al Reino de Macedonia.
La región estaba habitada por pelagonios, peonios e ilirios, y fue posteriormente colonizada por los macedonios.
Estrabón[1] llama a Pelagonia Tripolitis, en referencia a las tres ciudades de la antigua Pelagonia.
Actualmente, Pelagonia (o Pelagonija) es un valle dividido entre Macedonia del Norte y Grecia.
Incorpora las ciudades macedonias de Bitola y Prilep y la griega de Flórina, así como el paso fronterizo clave de Medžitlija-Niki.