Seguidamente, en 1821, participó bajo las órdenes del general, José Francisco Bermúdez, en las campañas de Caracas y Santa Lucía.

[1]​ En Bogotá, estudió matemática y geometría analítica, bajo la conducción del fraile franciscano Tomás Sánchez Mora, y formó parte de los círculos intelectuales agrupados en diversas sociedades literario-filosóficas de la capital neogranadina.

Capturado, fue llevado nuevamente a la fortaleza donde se le colocó un par de grillos.

Radicado en Maracaibo, organizó un cuerpo miliciano de 1000 hombres, con el cual pasó la frontera y expedicionó sobre Río Hacha, que se había rebelado contra el gobierno del general Rafael Urdaneta.

"El mundo es del hombre justo", le contestaría el presidente, quien partió exiliado a la isla de Saint Thomas.

Al frente del batallón Anzoátegui, Carujo fue uno de los más combativos participantes en esa guerra civil.