Este proyecto fracasó durante su gestión legislativa por un desencuentro entre el grupo armado y el Gobierno Federal.

Esto hizo que su administración se caracterizara por la contribución a favor de la paz y la gobernabilidad.

Logró múltiples acuerdos de reconciliación en una sociedad que se encontraba profundamente dividida por conflictos sociales, políticos y religiosos.

[2]​ Al inicio de su gobierno, Chiapas se situaba en los últimos lugares del país; al concluir su administración, se destacaron los siguientes resultados económicos y sociales: Los logros anteriores se tradujeron en reconocimientos nacionales e internacionales para el gobierno encabezado por Pablo Salazar Mendiguchía, entre los que destacan: En el 2011, fue detenido acusado por los presuntos delitos de peculado por 104 millones de pesos, ejercicio indebido del servicio público, abuso de funciones públicas, abuso de autoridad y asociación delictuosa.

A principios del 2012 un juez le dictó auto de formal prisión.