La sede de la diócesis tuvo varios emplazamientos: Leal (hoy Lihula), Vana-Pärnu (Pärnu antigua), Haapsalu y finalmente el castillo de Kuressaare en la isla Saaremaa.

A esta orden se le asignó un tercio de todas las islas de la diócesis, pero el obispo retuvo los derechos espirituales allí.

Se mantuvo allí la sede hasta 1251, cuando el obispo Heinrich fundó Vana-Pärnu, y construyó allí la Catedral de Jesucristo, la Virgen María y Juan Evangelista.

El obispo fue hecho prisionero y la iglesia de Leal fue destruida.

Luego los territorios capturados fueron devueltos a la diócesis tras la intervención de los representantes papales en 1302.

A partir del siglo XIV la residencia del obispo estuvo ubicada alternativamente en Haapsalu y en Kuressaare, en donde se encuentra el Castillo episcopal de Kuressaare.

El obispo Munchausen viajó a Dinamarca y luego a Alemania, en donde para 1566 ya era un predicador luterano y murió el 23 de enero de 1572.

A principios de agosto Suecia conquistó Haapsalu y en septiembre toda Hiiumaa.

En 1570 Magnus viajó a Rusia y se pasó al Imperio ruso, pero fracasó en su intento de conquistar Livonia.