El Nitto Maru se había topado con los buques estadounidenses en el transcurso del desarrollo de la Incursión Doolittle, el pequeño navío fue detectado visualmente por los estadounidenses, así como el mensaje radial emitido por los vigías japoneses y cundió la alarma.

El vicealmirante Halsey ordenó al USS Enterprise el despegue, el ataque inmediato y destrucción de los navíos japoneses circundantes a la fuerza naval y en la ruta hacia Japón, asimismo ordenó al crucero ligero USS Nashville cañonear y hundir al Nitto Maru, el pequeño navío intentó escapar pero la mar gruesa no solo dificultaba su marcha; también dificultaba el dar en el blanco para los estadounidenses.

Los sobrevivientes del Iwata Maru fueron rescatados por el submarino I-174 y transferidos al Kiso.

Recibió un impacto fatal aproximadamente a las 8:20 horas, hundiéndose con total perdida de vidas.

Los aviones del USS Enterprise dañaron a 8 navíos relativamente cercanos, hundieron a los buques menores de vigilancia Nagato Maru y al Iwata Maru antes de volver al portaviones.