Nicolás Suárez y Ponce de León nació entre 1590 y 1595 en Almaguer, en Cauca,[2][3] en lo que hoy es Colombia, entonces parte del Nuevo Reino de Granada.
[4][5] Su padre fue capitán y Justicia Mayor del Virreinato del Perú, mientras que su abuelo paterno fue el Capitán Alonso Suárez de Pereda, y su abuelo materno, Fernando Ponce de León, fue uno de los primeros conquistadores españoles del Perú.
[6] En 1622 Ponce de León comenzó su servicio militar con el ejército español en varias acciones contra insurrectos indígenas en la provincia de Santa Marta, cuando era administrativamente parte del Reino Nuevo de Granada.
[12] Fue enterrado en el cementerio de San Agustín.
[13] Nicolás Ponce de León se casó con Estefanía Mendoza D'Ávila y Mendoza en la Catedral de Sevilla entre 1625 y 1629, y tuvieron siete hijos: Isabel (1630), Estefanía (1630 o 1631), Nicolás (1633), Juana María (1635), Manuel (1637), María (1639) y Felipe (1641).