Los usuarios deben iniciar la sesión con una Cuenta Nintendo, la cual se puede crear desde cero, o usando una cuenta de Nintendo Network, Twitter, Facebook o Google+.

Los usuarios consiguen tres tipos de moneda al completar diversas misiones.

También se pueden canjear por productos para Miitomo, tales como vales de juego o ropa.

En noviembre de 2015 se anunció My Nintendo, al mismo tiempo que detalles sobre el programa.

Todos los países cuentan con eShop local (al menos en Nintendo 3DS), con la capacidad para comprar contenido digital con su moneda local: Esta lista fue expandida a 151 países con la salida de Super Mario Run.